コウモリ駆除の費用相場・業者の選び方｜時期・鳥獣保護法・悪徳業者対策まで徹底解説

コウモリ駆除の費用相場｜被害規模別の目安と内訳

コウモリ駆除の費用は、被害が1箇所の軽度なものから天井裏全体に及ぶ重度のケースまで大きく異なります。「業者によって言い値がバラバラ」と感じることが多いのは、この費用の幅が広いためです。

まず被害規模別の目安を把握しておくことで、現地調査後の見積もりを正しく判断しやすくなります。

被害規模別の費用目安

軽度の被害：1〜5万円程度

軽度の被害とは、通気口や換気口など特定の1〜2箇所からコウモリが侵入しているケースです。外壁への糞の付着や軒下への少量の堆積は見られるものの、天井裏への巣作りには至っていない段階が目安になります。

この段階であれば、作業範囲が限定されているため比較的短時間で完了し、費用は忌避剤の散布・侵入口閉塞・簡易清掃を含めて1〜5万円程度が目安です。

被害が少ないうちに対処できるほど費用が抑えられるため、少量でも糞を見かけたら放置しないことが大切です。

中度の被害：5〜15万円程度

中度の被害とは、外壁・軒下の複数箇所から侵入しており、天井裏に糞の堆積が始まっているケースです。複数のコウモリが建物に住みついており、糞の量も目に見えて多くなっている状態です。

侵入口が複数あるため閉塞工事の規模が拡大し、天井裏の糞清掃・消毒が必要になります。屋根の形状や建物の高さによっては足場の設置や高所作業が必要になることもあります。作業項目が増えるため費用は5〜15万円程度が目安となります。

なお、天井裏から重い足音がしたり、一箇所に集中した「溜め糞」が見られたりする場合は、コウモリではなくハクビシンやイタチの可能性があります。
見分け方は「イタチ・ハクビシン駆除の費用相場・見分け方」で解説しています。

重度の被害：15〜30万円以上

重度の被害とは、天井裏に複数のコウモリが長期間にわたって巣を作り、糞の被害が広範囲に及んでいるケースです。断熱材への糞の浸透や木材の腐食が起きているほか、アンモニア臭が室内まで漂うようになっている状態です。

追い出し・全侵入口の閉塞・広範囲の糞清掃・消毒・消臭に加え、断熱材の交換が必要になることもあります。作業員の人数・日数ともに増えるため費用は15〜30万円を超えるケースも珍しくありません。被害が大きいほど費用がかかるため、初期段階での対処が重要です。

コウモリ駆除費用の内訳

コウモリ駆除の費用は、主に以下の項目で構成されます。

現地調査を無料で行っている業者も多いため、まずは調査を依頼して被害の範囲と費用の全容を確認することをおすすめします。

価格.com害獣駆除での費用事例

価格.com害獣駆除で実際にお支払いいただいた最小費用は3,300円(税込)〜、費用相場（中央値）は66,000円(税込)前後でした。（2026年5月30日時点）

※軽微な追い出し・侵入口の閉塞から天井裏の糞清掃・断熱材交換まで、被害の状況によって費用の幅が大きく異なります。

価格.com害獣駆除への見積もり依頼は無料ですので、まずはお気軽にご相談ください。

費用を左右する3つの要因

侵入箇所の数と場所

侵入口が1箇所であれば閉塞工事は最小限で済みますが、複数の隙間から侵入している場合は工事の規模が拡大します。屋根の頂上付近など高所への作業が必要な場合は、足場の設置費用が別途かかることもあります。

糞の被害範囲

コウモリの糞は酸性で腐食性が強く、断熱材や木材を傷めます。被害が断熱材にまで及んでいる場合は断熱材の交換が必要になり、費用が大幅に膨らみます。

異変に気づいたら早めに対応することがコスト削減の観点からも重要です。

建物の構造・規模

建物の年数・構造・規模によって侵入口の数や作業の難易度が変わります。築年数の古い一戸建ては外壁の経年劣化や軒下・屋根の隙間が多く生じており、コウモリが侵入できる箇所が多数存在する傾向があります。

屋根の形状が複雑な建物や総二階（床面積や形状がほぼ同じシンプルな四角形の2階建て）でない建物は、軒先や妻壁など高所へのアクセスが難しく、作業費用が上がりやすい要因になります。

一方、集合住宅・マンションでは侵入箇所が共用部（外壁・屋上・換気口）に及ぶ場合は管理会社や管理組合との調整が必要になり、作業の許可取得や施工範囲の調整により工期が延びることもあります。

コウモリは自分で駆除できる？鳥獣保護法の注意点

コウモリの「追い出し」は自分でも行えますが、捕獲・殺傷は鳥獣保護管理法で禁止されています。

「害獣なのになぜ？」と疑問に思う方も多いですが、コウモリは建物や農作物に被害を与える一方で、害虫を捕食する益獣としての側面もあるため、法律で保護されています。

なお、同じ屋根裏に住み着く害獣でも、鳥獣保護法の対象外であるネズミは駆除方法が大きく異なります。
費用相場や侵入経路対策は「ネズミ駆除の費用相場｜業者選び・侵入経路まで解説」をご覧ください。

捕獲・殺傷は禁止｜鳥獣保護法の罰則

鳥獣保護管理法に違反した場合の罰則は、1年以下の懲役または100万円以下の罰金です。「知らなかった」では済まないため、自己判断での殺傷・捕獲は原則として避けてください。

ただし、コウモリを「追い出す」行為は捕獲・殺傷には当たらないため合法です。

専門業者も同様に、忌避剤による追い出し＋侵入口の封鎖という方法でコウモリを家から排除します。

同様に鳥獣保護法で保護されているハトも、捕獲・殺傷はできず「追い出し」のみが対応の基本です。費用相場や対処法は「ベランダのハト駆除費用と鳥獣保護法の注意点」で解説しています。

自分でできること｜忌避剤を使った追い出し

侵入箇所が1〜2箇所に限定されており被害が軽度な場合は、忌避剤を使って自分で追い出しを試みることができます。

市販の忌避剤（ハッカ油系スプレーやナフタレン系忌避剤）をコウモリの侵入口や休憩場所に散布し、コウモリが出払った夕方以降に侵入口をふさぐのが基本手順です。

費用は忌避剤と封鎖資材を合わせて数千円〜1万円程度に抑えられます。

ただし、繁殖期・冬眠期は追い出しの効果が落ち、天井裏・高所作業には安全上のリスクも伴うため、注意が必要です。

プロに依頼すべきケース

以下のようなケースでは、無理に自分で対処せず、専門業者への依頼をご検討ください。

侵入箇所が複数ある、または高所・天井裏に及ぶ場合

侵入口が複数あると、一つを塞いでも別の箇所から再侵入されるため、すべての侵入経路を同時に特定・閉塞することが必要です。

また、屋根裏や高所への作業は安全装備と専門知識が必要であり、一般の方が対処しようとすると転落などの事故リスクがあります。確実かつ安全に作業を完結させるためにも、専門業者への依頼が適切です。

糞の被害が広範囲に及ぶ場合

コウモリの糞には乾燥すると空気中に舞い上がる菌が含まれることがあり、マスクや防護服なしでの作業は健康上のリスクが伴います。

また、断熱材への浸透が疑われる場合は被害の全容を正確に把握するための調査が必要です。専門業者に依頼することで、適切な防護措置のもとで清掃・消毒を行ってもらえます。

繁殖期または冬眠期で自分での対処が困難な場合

繁殖期（6〜8月）は子コウモリが巣にいるため、素人判断で追い出しを行うと思わぬトラブルが生じる可能性があります。

冬眠期（11〜3月）は忌避剤の効果が大幅に低下し、追い出しそのものが難しい状況です。

専門業者は状況を見極めながら安全・合法的に対応するノウハウを持っているため安心です。

過去に自分で対処したが再発した場合

市販の忌避剤での追い出しは一時的に効果を発揮することがあっても、侵入口が残っていれば数週間〜数か月で再び侵入されます。

再発を繰り返している場合は、自分では特定できていない侵入経路が残っている可能性が高く、専門業者が熟練した目で漏れなく侵入経路を特定し、再発防止のための閉塞工事を実施します。

コウモリ駆除の適切な時期｜いつ依頼すれば良い？

コウモリ駆除に適した時期は、春（4〜6月）と秋（9〜10月）です。

繁殖期（6〜8月）や冬眠期（11〜3月）は作業が困難になるため、これを知らずに対処しようとしても効果が出なかったり、倫理的・法的な問題が生じたりします。

駆除の適期：春（4〜6月）と秋（9〜10月）

コウモリが活発に活動しており、かつ繁殖前後のタイミングである春（4〜6月）と秋（9〜10月）が駆除の適期です。

• 春（4〜6月）：繁殖期（6〜8月）が始まる前に対応できるため、子コウモリが生まれる前に家から排除できる。夏のピーク需要（7〜8月）前のため業者の予約も取りやすい
• 秋（9〜10月）：繁殖期が終わり、子コウモリも独立した後。冬眠前に施工すれば翌年の再発を防ぎやすい

避けるべき時期：繁殖期（6〜8月）と冬眠期（11〜3月）

繁殖期（6〜8月）は子コウモリが巣の中にいます。この時期に親を追い出すと子コウモリが取り残されて死亡し、腐敗による悪臭と衛生問題が発生する可能性があります。倫理的な問題だけでなく、死骸の撤去費用も別途かかるため、この時期の無理な駆除は避けてください。

冬眠期（11〜3月）は、コウモリの動きが鈍く忌避剤への反応が著しく低下します。追い出しの効果が出にくいうえ、壁の内側など深い場所で冬眠しているコウモリを追い出すのは困難です。

「夏になってから慌てて連絡する」というケースが多く、繁忙期は業者の予約が取りにくくなります。コウモリの存在に気づいたら、春先（4〜5月）の段階で早めに動くことが費用・手間の両面で有利です。

コウモリ被害は市役所に相談できる？補助金の実情

市役所への相談は可能ですが、コウモリの駆除作業は行っておらず、補助金も原則として対象外です。

「市役所に相談すれば無料で対処してもらえるのでは」「補助金が使えれば費用を抑えられるのでは」と期待する方は多いですが、実情は限られています。

市役所はコウモリ駆除を実施しない

多くの自治体では、コウモリが民間住宅に侵入した場合の駆除作業を行っていません。市役所（保健所・環境衛生課）に問い合わせると、以下のような対応にとどまるケースがほとんどです。

• 対処法や忌避方法についてのアドバイス
• 地域の害獣駆除業者の紹介・あっせん
• 公道・公共施設における死骸の回収（一部自治体）

相談窓口として活用することはできますが、「駆除は専門業者へ依頼してください」という回答が一般的です。

補助金・助成金は原則対象外

国が設けている害獣対策補助金はイノシシ・シカ・クマなど農作物に被害を与える鳥獣が対象であり、コウモリは原則として補助金の対象に含まれません。一部の自治体で個別に補助制度を設けているケースもありますが、極めて限られています。

ただし、コウモリの糞害によって屋根裏の断熱材や木材が損傷した場合は、住宅リフォーム補助制度や火災保険（破損・汚損特約）が適用できる可能性があります。

費用の節減策として、まず加入している火災保険の約款を確認してみることをおすすめします。

悪徳業者に注意！高額請求トラブルと優良業者の選び方

コウモリ駆除を業者に依頼する際は、費用の目安や契約の注意点を事前に把握しておくことが重要です。

高額請求トラブルが起きる理由

悪徳業者がとる主な手口は以下のとおりです。

• 点検商法：「無料点検」を名目に訪問し、十分な説明がない上で「天井裏がひどい状態」とだけ伝え不安をあおって高額な工事を契約させる
• 作業後の追加請求：事前に相談もなく、当初の見積もりより「被害が広かった」と称して契約後に金額を引き上げる
• 不要な施工の押し売り：被害のない箇所にも施工を提案して費用を水増しする
• 書面を渡さない：口頭説明のみで見積書・契約書を作成せず、後から言い値を請求する

優良業者を選ぶチェックポイント

「今日契約しないとコウモリが増える」と急かしてくる業者や、書面を渡そうとしない業者は要注意です。その場での即決は避け、内容を持ち帰って確認する時間を確保してください。

トラブルになった場合は、消費者ホットライン「188」に相談することをおすすめします。

なお、価格.com 害獣駆除では、お客様の条件に合わせて最適な業者を1社マッチングするため、ご自身で業者を比較・選定する手間は不要です。実際の利用事例と費用も確認できるので参考にしてください。

コウモリ駆除に関するよくある質問

コウモリ駆除の費用はどのくらいかかりますか？

コウモリを自分で駆除することはできますか？

コウモリ駆除に適した時期はいつですか？

市役所や補助金でコウモリ駆除の費用を抑えられますか？

マンション・アパートでコウモリが出た場合、誰に相談すればよいですか？

まとめ

コウモリの被害は天井裏に糞が蓄積するほど、清掃・消毒・断熱材交換の費用がかさんでいきます。「まだ少ないから大丈夫」と様子を見るうちに、繁殖期を経て数十匹規模になるケースも珍しくありません。

被害に気づいたら、まずは専門業者に無料の現地調査を依頼して、被害の範囲と費用の見当をつけることからはじめましょう。